
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
钻研结果显示
深入分析职工科学探究发生变化冷冻事件不断增多羊肉片的强度、持水利、汤色、存在态铁浓度、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4横向来评定背部肌肉策划 癌体细胞的铁身故情形。报告出现,冷冻事件不断增多后,羊肉片的强度在第8天和第6天差异性上升;持水业务能力较低;色彩变深,损失金属光泽,鲜橘粉红色变成暗橘粉红色。除此以外,存在态铁、活性酶氧和MDA的浓度差异性增多,癌体细胞凋亡率差异性增加。 探析考生转化成有所的差异于冷库日子的相关肌肉群仿品的淀粉酶质,然后呢开展SDS-PAGE探讨,淀粉酶质条带在有所的差异于时间段分布不均均匀分布且类似(图1a)。跟据淀粉酶在有所的差异于仿品中的展示状态,探讨出现相同一时间组仿品的中四位数靠近于相同一时间水准(图1b),证明相关肌肉群仿品淀粉酶质存在非常好的组内类似性和组间的差喜欢的人。 蛋清酶质组学共亲子评定出1996种蛋清酶质。以B0为比对组,筛分B1、B2、B4和B6中的蛋清酶完成差别呈现分折,共亲子评定到37几个DEPs。将火山图web3d,并依据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05一个标分折DEP。报告如1c-f体现,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别亲子评定出22、33、73和140个DEPs,其中的分头别调整6、11、32和8九个,变动16、22、41和53个。聚类分析法的方式分析了各个冷冻箱第一阶段健身肌群进行中蛋清酶质的呈现,报告显示信息健身肌群蛋清酶呈现差别跟随永久保存准确时间的上升而上升(图1g)。
图1| 区别冷藏箱耗时的全身肌肉样机蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同于冷冻冷藏时期的肌群样品英文差别蛋清分折(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡者血清肽的PRM酶联免疫法分折(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用场景KEGG含有不同之处表达方式淀粉酶的铁阵亡规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱菌物提供了TMT按量血清质组学系统应用保障项目,拜谱生物系统已研制成功完成并设立了落实较为成熟的转录组学、血清组学、分解代谢组学还有几组学综合食品系统应用保障项目装修标准,欢迎致电咨询!
可以参考专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.