
2024年9月由武汉农业科技大学生张万刚先生公司在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物体为该研究提供了亚硝基化掩盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名字主题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
刊物:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2026年不良影响分子:5.7
说出时长:2024年9月
的客户方:南京农业大学
科学研究涂料:蛋白
拜谱出示能力:亚硝基化修饰组学
技术工艺线路:
一、探索最终结果
01.Caspase-3催化活性
当下尚不明确NO对caspase-3的克制作而成用会不会归因于NO介导的S-亚硝基化,差异浓硫酸浓度等度的GSNO做为外源性NO产生,以诱发caspase-3的休外S-亚硝基化。结果显示说明,与还没有GSNO的组不同之处,100、200和400μM GSNO组的caspase-3活力正相关减小(图1),与此前新闻稿相同。GSNO补救减小caspase-3活力的因素根本原因仍急待阐述。
图1 各不相同酸度的GSNO加工对caspase-3活性酶类的影响到
02.Caspase-3的S-亚硝基化的情况
研发Caspase-3的亚硝基化限度,以说明GSNO对Caspase-3的反馈性。经GSNO办理后,测量到caspase-3球蛋白S-亚硝基化抗拉强度新增(图2)。一些同时说明,外源性GSNO教育培养可取得胜利诱导性caspase-3的休外S-亚硝基化。真令人震惊的是,在没得GSNO现实存在的比较组中测量到一位薄弱的S-亚硝基化带,这说明caspase-3很有可能发生的内源性的S-亚硝基化。与此同时,本研发中caspase-3的S-亚硝基化限度较高,而caspase-3的抗逆性影响,这与已经的研发不一样。同时,caspase-3的特情人S-亚硝基化装饰位点尚不看清楚,还还要进一部的探索世界。
图2 GSNO治理对caspase-3S-亚硝基化品质的引响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化突显组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文字段。蓝色的标出的回文字段提出S-亚硝基化肽,灰色标出的C提出S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3化学降解结蛋清
结球球蛋清身为1种极为核心的生殖上皮细胞骨架球球蛋清,在达到肌生殖上皮细胞格局的格局完全性和紧缩性角度起着极为核心技能,探究S-亚硝基化caspase-3对结球球蛋清溶解的铭主观兼有极为核心必要性。与Std(未用胱天球球蛋清酶-3和GSNO孵育的初始值肌植物氯纶球球蛋清)组相比之下,0 μM GSNO组(肌原植物氯纶和caspase-3的孵育,无GSNO)的完全结球球蛋清占比不错缩减,提示信息caspase-3对结球球蛋清兼有隐藏的的球球蛋清淀粉酶酶质水解技能。在GSNO孵育后,完全结球球蛋清的占比很明显增添(P < 0.05)。再者,当GSNO酸度增高时,完全结球球蛋清的占比快速调涨(P < 0.05)(图5)。某些挖掘显示,SNO淡化的caspase-3以品质依懒的原则能够抑制结球球蛋清的溶解。
图5.S-亚硝基化caspase-3化学降解结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3光降解肌钙蛋清-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清调试器提供肌群紧缩的丝条的都要肌原食物棉合成纤维蛋清。TnT的可化学光化学生物降解共同点是测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化條件下,caspase-3对TnT的可化学光化学生物降解具体情况如图如下图所示6如下图所示,与Std组(含有caspase-3和GSNO的肌原食物棉合成纤维)想必,caspase-3组中30 kDa TnT段落正相关多,阐明caspase-3加入了TnT的可化学光化学生物降解,最后,caspase-3与GSNO的孵育诱发30 kDa TnT增涨。在100和200 μM GSNO组彼此不会有测量到很明显的不同(P > 0.05),而当GSNO的溶度达标400 μM 时,该段落正相关限制(P < 0.05)。那些感觉阐明了SNO表达的caspase-3对TnT可化学光化学生物降解的压创角色。结蛋清和TnT是caspase-3的敏感度底物,而GSNO治疗缩减caspase-3的活力酶类将诱发肌原食物棉合成纤维蛋清可化学光化学生物降解成度缩减。上述情况经验,NO引诱的S-亚硝基化行采用表达半胱氨酸残基来调试器caspase-3的活力酶类,而能进那步损害其对结蛋清和TnT的蛋清油脂水解性能,而使损害牛肉片品格。
图6. S-亚硝基化caspase- 3吸附肌钙球蛋白-T
二、总结
本理论研究重在论述S-亚硝基化对caspase-3装饰的应响以及其其次对羊肉肌原仟维离体分解的应响。血清质质S-亚硝基化应该装饰caspase-3的半胱氨酸残基,关键在于引发caspase-3渗透性降低了,进那步缓和了其对羊肉肌原仟维血清质质的血清质质蛋白质水解特性。三、拜谱个人总结
论述主要包括了酶活测试,亚硝基化表达组学介绍,WB等检查行为,感觉蛋清质S-亚硝基化还可以表达caspase-3的半胱氨酸残基,这导至了caspase-3抗逆性的削减,并举一个步骤减缓了其对牛羊肉肌原弹性纤维蛋清质的蛋清质水解反应专业能力。本论述为表达蛋清质质亚硝基化对肉肥的监测系统给予半个个新的的视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的淀粉酶质组学、淡化淀粉酶质组学、产生组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸一系列服务,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total被氧化抹除、徘徊巯基,欢迎大家咨询!
分类期刊论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663