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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原动物群特女性朋友、寡核苷酸淡化资金激昂或使用步奏比较复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教受人员在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低总成本、跨鱼类、全app兼容的全新解决方案。

刊物详细介绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国人数学分析院基因基因遗传性的与发育期海洋植物学分析所和我国人基因基因遗传性的自学主办人的知名科研刊物,秉承于新闻稿性命数学分析和中医学基因基因遗传性的学的行业行业的亿人性分析科技成果。JGG 202四年度的影响成分7.1,Scopus科研刊物判断指数公式CiteScore 9.9,名列JCR 202四年度GENETICS & HEREDITY的行业行业Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY的行业行业Q1区,名列我国人数学分析院刊物分离海洋植物学种类别1区(Top刊物),基因基因遗传性的学和什么是生化与分子式海洋植物学小类双1区。

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之类是HEATag

比较巧妙的“二一体”设汁

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成部分的构建蛋白酶

「定位系统器」控制模块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化体现(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连接方式器」控制器 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)检索长条型码开展共价联接。

“1+1>2”的体验:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样品标注与追溯。

Fig1: HEATag很多标志操作过程展示图

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实战技巧检定

HEATag又有多用打?

就可以在的不同先决条件下,保证辅乳小动物组织细胞膜系单组织细胞膜混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。研发微商团队为 HEATag 设定了多轮 “重压测试方法”,从神经细胞膜系到神经细胞膜核,从超温度低到温度低,从新鲜范例到固定的范例,全座向验证通过它的不稳性和是真的吗性。

独第一阶段检验对喂奶家禽人体人体癌细胞系:探索员工使用了出于人、鼠、仓鼠四个植物鱼类的哪几种人体人体癌细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在制冷使用 HEATag 箭头后结合测序。结果英文收售的 11447 个人体人体癌细胞中,85.66% 都能能够 HEATag 条状码较准相配到原植物鱼类,样品间双向污染破坏不多,UMAP 聚类了解法了解更要会直接证明信,HEATag 条状码与植物鱼类特喜欢的人DNA组特点相对高度高度。 没过多久,各种测试條件进步骤提升:调查的人员常试在 4℃下图标剥好的細胞、在在常温下图标甲醇稳定位置細胞,可能随时图标細胞核。成果依旧会醒目:很多條件下,子样品tag标签与种类个人信息均极具更好的重要性性,分割最准率超 95%。虽然甲醇稳定位置会造成的偶尔的转录本交错水污染,細胞核配制有小量 RNA 减少,細胞类型、的引用成果依旧会与剥好的子样品保证完全一致,证明书 HEATag 还可以图标不一样的整理條件下的测试子样品。

Fig2: HEATag 可在各种水平下达成单癌细胞转录组混样深入分析

要标记图片辅乳期小动物界和海洋资源无脊椎神经小动物界的原代神经细胞

假设说血神经元系测试图片是 “根本题”,那集体范本还是 “附带题”, 这样的范本经常因血神经元型号复杂化、区域适用于性特色,形成记号技木的 “重瓶颈问题”,而 HEATag 恰恰舞在这样的 “重瓶颈问题” 上表现了胜机。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组建,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不光能被精确界定,大部分包括组织结构类型的聚类算法然而都流畅可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海底生物技术的适用性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与动物群转录组具较高同一性,沒有会出现因高盐工作环境使得的 “图标没用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可构建辅乳生物集体样本量多个 scRNA-seq 进行分析

Fig4: HEATag可改变新鲜的海洋资源无脊梁骨生物众多 scRNA-seq 讲解

HEATag与组织的运用是不会出现转录组的显著性增加

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在做完标示目标的与此同时,也不会对险遭的转录多组分析造干忧,做到了理论研究数据源的完美性。

Fig5: HEATag就不会后果范本的 RNA 表明基本模式

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发展可期

HEATag 能为单细胞核分析介绍啥?

HEATag 的颜值,远不已于 “解决方法标识方面”,它的方便性和普遍意义,尚未为单细胞系探析点开较多将性

从运用场地了解

HEATag 能网络覆盖从 “简约较好数据分析”(如癌结构与正常人结构、肿瘤药物进行处理与相较比较)到 “大占比理论研发”(如结构癌上皮细胞图谱设计、高通芯片量建立)的全比率各种需求。如今 PIP-seq、Stereo-cell 等一种新型可加密技艺的发展前景,HEATag 还能全面骤升降单癌上皮细胞理论研发的通量,助推教育科研品牌团队展开更好 占比的品牌。

从跨领域行业潜能了解

HEATag 一方面使使用转录组学,还能与表观基因组组学、膳食纤维质组学、地方组学等能力切合,用自定义字段和寡核苷酸字段,HEATag 能够解乏带入差异的组学工作流程,不导致移动信号捕捉程度。时候,来源于HEATag还能够成长 单上皮细胞糖组学探索能力。

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合作方式新动态

拜谱微生物与陈凯教受确定逐项企业合作意项

值当目光的是,在 HEATag 技術利用出显出大利用能力的原型下,拜谱菌物学已与佛山地区大海菌物地理学与工程施工佛山实践室(佛山)陈凯专家完成分步媒体合作的想法。当事人打算重点围绕 HEATag 技術利用的财产化正式出台、科研运行管理项目生成等目标发展程度协同合作,促使上述成本低的费、跨动物群的单肿瘤神经细胞系符号技術利用快些利用于具体科研运行管理项目不一样,为许多实践室具备优质、经济实惠的单肿瘤神经细胞系设计用具,力助科研运行管理项目运行者在肿瘤神经细胞系菌物学学、大海菌物菌物学学、疾患机理等方面获取许多强化
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